氏格尔·库莱恩、巴特利葛·萨拉诉求获得PLANT内的自治权以及贸易自主权，组成政治结社"黄道同盟"，进行"废止粮食生产限制"以及"获取自卫权"之活动。
理事国扼杀这种活动，惹起Coordinator的反感。
除此之外，黄道同盟遁入地下活动，开始构成PLANT内的势力之一。
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乔治·格莱恩，被一名因为自己并非Coordinator而感到悲观的少年所暗杀，传闻在其背后有BlueCosmos的影子，但是真相不明。
之后PLANT的营运，由各市所派代表组成之"PLANT评议会"施行。
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S型流行感冒发生变种，过去所使用的疫苗无效化。
S2型流行感冒开始盛行。
开始有说法，认为S2型流行感冒是由Coordinator所主导，针对乔治·格莱恩被暗杀所做的报复行动；进而这是对Natural的歼灭作战。
（这两个说法共同盛行）
响博士，就自己与妻子的受精卵之一进行Coordinator的处理。
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将S2型流行感冒称呼为"神的铁锤"的宗教势力崛起，世人再次发生对改变基因之厌恶感，通过了《禁止改变基因协议》，通称《都灵议定书》。
"在地球上改变基因"再次受到禁止。
Natural反对Coordinator的情感，达到了冰点。
2/5，拉克丝·库莱恩，在PLANT诞生。
5/18，基拉·响、加嘉莉·响在Mendel诞生。
S2型流感造成的损害扩大，各地发生暴动，在Mendel的GARMR&D研究所，遭到以BlueCosmos为名的武装集团袭击。
事前察知此情报的响博士的妻子，将基拉与加嘉莉交给她的妹妹与妹夫，也就是大和夫妇。
10/29，阿斯兰·萨拉，在PLANT诞生。
在PLANT的アプリリウス市，对S2型流行感冒的疫苗开发成功，并且增产，开始对地球供给。
即使如此，Natural的反Coordinator情感并未回复，在地球上的Coordinator开始陆续移居到宇宙。
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