这4块进化石中的三块(水石、火石、电石)被小智得到(坂木老人送给小智的，来海底取进化石的应该是坂木老人)。
在第二章中小黄来到了这个传说中的海底世界。
彩虹市
彩虹市(英文:CdonCity日文：タマムシシティTamamushiCity)关东西部的大都市，使整个关东地区第二大的城市。
火箭队的基地位于这里。
タマムシ在日文里是"にじいろゆめのいろ"(彩虹的梦般的颜色)，对应彩虹色(虹色玉虫色，因光的照射角度不同而变成金绿和金紫的金花虫的身体的颜色)，其英文名字是灰绿色,青磁的意思。
原形认为是东京的新宿、涩谷、池袋以及八王子市。
对应彩虹色(虹色玉虫色，因光的照射角度不同而变成金绿和金紫的金花虫的身体的颜色)。
训练馆首领是莉加，使用草系神奇宝贝，打败她可以获得彩虹徽章(レインボーバッジRainbowbadge)。
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彩虹市百货大楼是关东地区最大的神奇宝贝用品市场。
那里有各种类型的，通常不能在其他地方找到的道具。
包括各类技能机,战斗中提升能力的道具(X提升系列:X命中,X攻击,X防御,X速度,X特攻,GuardSpec。
和DireHit),以及能提升能力的道具(9800元系列)。
还可以买到怪兽球，进化石(火石，草石，雷石，水石)。
另外在金银水晶中，这里买不到进化石。
在顶楼有一台自动贩卖机，卖矿泉水，苏打水和柠檬汁。
这三种饮料都可以提升口袋妖怪的亲密度。
在RGBY中，玩家必须在这里买一瓶水给去往黄金市通路上的守卫，这样他才会允许玩家进入。
另外，如果你给顶楼的一个女孩一瓶水，她会送给你一个技能机。
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彩虹大厦是坐落在城市北部的一栋大公寓。
在大厦的一楼，大楼的所有者，一个老太太住在那里，她的身边总是围绕着几只她的神奇宝贝。
在火叶中她扮演着一个重要的角色：给玩家茶，给任意一个黄金市的口渴的守卫，这样便可以进入这个城市。
游戏怪人(GameFreak),游戏的制作公司把自己放在了这里。
当玩家完成图鉴(收集全部150只神奇宝贝)之后,游戏怪人会颁发给玩家一个证明以奖励完成游戏。
在RGBY中，玩家可以在顶楼捡到一只伊布。
在RGB中，证明在游戏中看起来如下(英文版)：
GameDesigner:
Wow!
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